Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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