Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 381.6 ms