Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt27Q9Z320 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms