Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hdac5Q9Z2V6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac5Q9Z2V6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms