Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbd3Q9Z2D8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbd3Q9Z2D8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms