Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tulp1Q9Z273 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tulp1Q9Z273 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms