Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn7Q9Z261 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms