Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ap3b1Q9Z1T1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ap3b1Q9Z1T1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms