Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ddx39bQ9Z1N5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx39bQ9Z1N5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms