Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skp2Q9Z0Z3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms