Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dctn3Q9Z0Y1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dctn3Q9Z0Y1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms