Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp2Q9Z0E6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms