Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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AireQ9Z0E3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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AireQ9Z0E3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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AireQ9Z0E3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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AireQ9Z0E3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AireQ9Z0E3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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AireQ9Z0E3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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AireQ9Z0E3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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AireQ9Z0E3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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AireQ9Z0E3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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AireQ9Z0E3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AireQ9Z0E3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AireQ9Z0E3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AireQ9Z0E3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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AireQ9Z0E3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AireQ9Z0E3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AireQ9Z0E3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AireQ9Z0E3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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