Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin2Q9WVE8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pacsin2Q9WVE8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms