Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptpn4Q9WU22 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms