Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpv2Q9WTR1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpv2Q9WTR1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms