Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TapbpQ9R233 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TapbpQ9R233 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms