Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim3Q9R1R2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim3Q9R1R2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms