Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b2Q9R0K7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b2Q9R0K7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b2Q9R0K7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b2Q9R0K7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b2Q9R0K7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b2Q9R0K7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b2Q9R0K7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b2Q9R0K7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b2Q9R0K7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b2Q9R0K7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b2Q9R0K7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b2Q9R0K7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b2Q9R0K7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b2Q9R0K7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp2b2Q9R0K7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b2Q9R0K7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms