Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nek3Q9R0A5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nek3Q9R0A5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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