Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gpc6Q9R087 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gpc6Q9R087 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gpc6Q9R087 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc6Q9R087 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gpc6Q9R087 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gpc6Q9R087 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gpc6Q9R087 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc6Q9R087 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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