Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms