Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp21Q9QZL6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms