Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms