Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exo1Q9QZ11 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exo1Q9QZ11 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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