Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Phtf1Q9QZ09 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms