Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmeff2Q9QYM9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms