Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapbQ9QY76 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms