Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd4Q9QY39 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms