Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ6

Slco1a1, Solute carrier organic anion transporter family member 1A1, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1a1Q9QXZ6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Slco1a1Q9QXZ6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Slco1a1Q9QXZ6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Slco1a1Q9QXZ6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Slco1a1Q9QXZ6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Slco1a1Q9QXZ6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Slco1a1Q9QXZ6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Slco1a1Q9QXZ6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Slco1a1Q9QXZ6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Slco1a1Q9QXZ6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Slco1a1Q9QXZ6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slco1a1Q9QXZ6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Slco1a1Q9QXZ6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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