Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Limd1Q9QXD8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms