Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cyth1Q9QX11 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms