Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkain4Q9JMG4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms