Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms