Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM05

Pias4, E3 SUMO-protein ligase PIAS4, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias4Q9JM05 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pias4Q9JM05 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms