Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms