Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nectin3Q9JLB9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin3Q9JLB9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms