Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CubnQ9JLB4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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CubnQ9JLB4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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CubnQ9JLB4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CubnQ9JLB4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms