Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms