Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb3Q9JKS4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms