Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Irx5Q9JKQ4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Irx5Q9JKQ4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Irx5Q9JKQ4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Irx5Q9JKQ4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Irx5Q9JKQ4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Irx5Q9JKQ4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms