Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl39Q9JKF7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl39Q9JKF7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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