Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scamp5Q9JKD3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scamp5Q9JKD3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms