Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uchl3Q9JKB1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms