Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3glb1Q9JK48 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3glb1Q9JK48 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms