Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK23

Psmg1, Proteasome assembly chaperone 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg1Q9JK23 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmg1Q9JK23 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmg1Q9JK23 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms