Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cnga3Q9JJZ8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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