Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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