Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc86Q9JJ89 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms