Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sv2aQ9JIS5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms